По итогам конкурсов стипендии правительства Российской Федерации на 2018/2019 учебный год победителями признаны десять студентов и аспирантов ТУСУРа.
В соответствии с приказом Минобрнауки РФ стипендию правительства РФ будут получать тусуровцы:
Представители ТУСУРа также стали победителями ежегодных конкурсов стипендии президента Российской Федерации.
Конкурс стипендий президента Российской Федерации и правительства Российской Федерации для студентов и аспирантов проводится Минобрнауки России ежегодно. В нём участвуют студенты и аспиранты очной формы обучения, имеющие достижения в научно-исследовательской деятельности (статьи, дипломы конкурсов и конференций, победы в олимпиадах, акты, патенты, договоры на выполнение НИР и др.).
В Томском госуниверситете систем управления и радиоэлектроники открыт приём документов на программу именных стипендий президента ТУСУРа. В ней могут принять участие студенты, магистранты и аспиранты всех лет обучения.
Шесть студентов ТУСУРа стали победителями конкурсов стипендий имени первого ректора университета Григория Семёновича Зубарева, а также ректора университета (1981-1984 гг.), профессора Феликса Ивановича Перегудова.
По итогам ежегодных конкурсов на назначение стипендии Президента Российской Федерации и стипендии Правительства Российской Федерации из семи представленных конкурсных работ победителями признаны работы трех студентов ТУСУРа.
Осенью 2025 года состоялся ежегодный конкурс стипендий президента университета, который был учрежден в 2020 году президентом ТУСУРа, членом-корреспондентом РАН Александром Шелупановым.