Ученые ТУСУРа создали и апробировали технологию создания пористых мембран для задач молекулярной биологии по синтезу на их основе олигонуклеотидов.
В ТУСУРе отработали технологию создания подложек из оксида алюминия для синтеза олигонуклеотидов. Ранее подобная технология применялась для создания пористых мембран, которые используются в качестве фильтров, для целей инкубации микроорганизмов или синтеза наночастиц.
«Мы первыми в России адаптировали эту технологию для создания подложек для синтеза олигонуклеотидов, а также разработали и зарегистрировали специализированное программное обеспечение для контролирования процесса синтеза, - рассказывает заведующий лабораторией аддитивных технологий и инженерной биологии (ЛАТИБ) Руслан Гадиров. – На данном этапе уже готовы лабораторные образцы, мы проводим экспериментальные исследования эффективности подложек для принтерной печати олигонуклеотидов».
Перед использованием подложки проходят определенную химическую модификацию для того, чтобы на поверхности пор появились якорные группы, на которых возможен рост олигонуклеотидов – эта технология применима и для обработки пористых стекол, которые используются в обычных синтезаторах (ученые ТУСУРа получили патент на изобретение «Способ получения подложки для массового параллельного синтеза олигонуклеотидов»).
По словам ученого, разработанная технология позволит создавать подложки с нужными характеристиками пор, толщиной и геометрией.
«При использовании готовых подложек мы были ограничены круглой формой. В то же время для синтеза олигонуклеотидов с помощью геномного принтера удобнее в применении подложки прямоугольной формы», – уточнил Руслан Гадиров.
На данном этапе ученые приступили к отработке технологии второго типа подложек – для синтеза олигонуклеотидов с применением технологии фотоактивации. Уже проходят первые эксперименты, после которых будет проводиться оптимизация параметров.
«При изготовлении подложки проводится электрохимическое окисление алюминия. При изменении напряжения в процессе анодирования по определенному закону, внутри пор появляются периодические изменения диаметра, которые повторяют профиль напряжения, который мы задаем. Таким образом, варьированием напряжения мы можем менять структуру. В зависимости от расстояния между перетяжками появляется разная окраска подложек, – рассказывает об отличиях заведующий ЛАТИБ. – Для адаптации технологии для фотоактивации нам нужно обеспечить определенные оптические характеристики подложек. В последующем, подложки, скорее всего, будут без окраски, но на этапе экспериментов в видимом диапазоне работать проще, поскольку можно даже визуально наблюдать изменения цвета изделий при варьировании режимов окисления».
Осенью 2021 года Томский госуниверситет систем управления и радиоэлектроники стал победителем конкурса Минобрнауки на создание отечественной приборной базы для генетических технологий. Исследователи получили на проведение этих работ 410 миллионов рублей в рамках реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019 ‒ 2027 годы. Консорциум из трёх томских университетов во главе с ТУСУРом (также – ТГУ и СибГМУ), Института химической биологии и фундаментальной медицины и НИЦ Курчатовский институт выполняют разработку отечественного геномного принтера, основанного на технологии субмикролитрового дозирования жидкостей. Целью проекта является обеспечение технологической независимости в области приборной базы для проведения на территории Российской Федерации масштабных исследований в области генетических технологий. Технология найдёт применение и в других наукоёмких секторах российской промышленности. Индустриальным партнером проекта, обеспечивающим внедрение полученных результатов и производство оборудования для автоматизированного синтеза, является АО «Научно-производственная фирма «Микран».
В рамках XX Международной научно-практической конференции «Электронные средства и системы управления» состоялась школа-семинар по теме «Опыт разработки и эксплуатации отечественного синтезатора олигонуклеотидов».
В Передовой инженерной школе «Электронное приборостроение и системы связи» им. А. В. Кобзева разработали подложки из анодированного оксида алюминия для синтеза олигонуклеотидов.
Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН проверили точность синтеза олигонуклеотидов, полученных с помощью геномного принтера, разработанного в ТУСУРе.
Томские университеты – участники консорциума по реализации проекта «Разработка технологии субмикролитрового дозирования жидкостей для задач инженерной биологии, создание и практическая апробация опытного образца системы автоматического синтеза олигонуклеотидов на ее основе» во главе с ТУСУРом, приглашают на повышение квалификации в области геномной инженерии.